PLATAFORMAS DE SERVICIOS CIENTíFICO-TéCNICOS

Plataforma de Genómica y Transcriptómica

Laboratorio de Genómica

Personal técnico

Elena Serrano
E-mail: eserrano@santpau.cat / sequenciacio_ir@santpau.cat

Funciones

  • Secuenciación de próxima generación: genotipado completo del transcriptoma, RNA-Seq, Amplio-Seq, chip-Seq, la secuenciación de amplificación y secuenciación e identificación de microorganismos.
  • Secuenciación capilar: análisis de mutaciones, identificación de microorganismos y validación de líneas celulares.
  • Análisis de fragmentos: inestabilidad de microsatélites, la pérdida de heterozigositat en estudios de condiciones patológicas, la detección de mutaciones y la Genotipificació, la cuantificación del número de copias de genes, estudios de metilación y estudios de polimorfismos asociados con estados de enfermedad.

Equipamiento

  • Ion Torrent S5 Next Generation Sequencing System.
  • Ion OneTouch (TM) System.
  • 3130xl Genetic Analyzer capillary electrophoresis sequencer.

Laboratorio de Transcriptómica

Personal tècnico

Sandra Camino
E-mail: SCamino@santpau.cat / transcriptomica@santpau.cat

Funciones

  • Hibridación y análisis de Affymetrix microarrays.
  • Perfiles de expresión de ARN y micro-ARN en condiciones normales y en enfermedades y durante su tratamiento.
  • Pérdida de heterozigosidad, análisis del número de copias y la detección de mutaciones en todo el genoma.
  • Vinculación y estudios de asociación de todo el genoma.
  • PCR en tiempo real cuantitativa (la expresión génica, la discriminación alélica). Evaluación de la calidad de ácido nucleico.
  • Cuantificación de ácidos nucleicos (Bioanalyzer, Nanodrop).

Equipamiento

  • Affymetrix array platform (upgrade 7G).
  • Real time quantitative PCR ABI 7900HT (384-well plates and TLDA).

Subvenciones

  • IRHSCSP. “Affymetrix Microarrays System”. Cofinanciación: FEDER.
  • IRHSCSP. “Real time quantitative PCR ABI Prism 7000”. IF02/3693. Cofinanciación: FEDER.
  • IRHSCSP. “DNA genetic analyzer and protein arrays platform for the Genomics and Proteomics area of the Technical Laboratory for scientific and technical support”. IF07/3675-1. Cofinanciación: FEDER.

Formularios

Formulario Servicio Genómica

Formulario Servicio Transcriptómica

Última actualización: 13 de junio de 2019