PLATAFORMES DE SERVEIS CIENTìFIC-TèCNIC

Plataforma de Genòmica i Transcriptòmica

Laboratori de Genòmica

Personal tècnic

Elena Serrano
E-mail: eserrano@santpau.cat / sequenciacio_ir@santpau.cat

Funcions

  • Seqüenciació de pròxima generació: genotipat complet del transcriptoma, RNA-Seq, Ampli-Seq, xip-Seq, la seqüenciació d’amplificació i la seqüenciació i identificació de microorganismes.
  • Seqüenciació capil·lar: anàlisi de mutacions, identificació de microorganismes i validació de línies cel·lulars.
  • Anàlisi de fragments: inestabilitat de microsatèl·lits, la pèrdua de heterozigositat en estudis de condicions patològiques, la detecció de mutacions i la Genotipificació, la quantificació del nombre de còpies de gens, estudis de metilació i estudis de polimorfismes associats amb estats de malaltia.

Equipament

  • Ion Torrent Personal Genome Machine.
  • Ion OneTouch (TM) System.
  • 3130xl Genetic Analyzer capillary electrophoresis sequencer.

Laboratori de Transcriptòmica

Personal tècnic

Elena Serrano
E-mail: eserrano@santpau.cat / transcriptomica@santpau.cat

Funcions

  • Hibridació i anàlisi de Affymetrix microarrays.
  • Perfils d’expressió d’ARN i micro-ARN en condicions normals i en malalties i tractament.
  • Pèrdua d’heterozigositat, anàlisi del nombre de còpies i la detecció de mutacions en tot el genoma.
  • Vinculació i estudis d’associació de tot el genoma.
  • PCR en temps real quantitativa (l’expressió gènica, la discriminació al·lèlica). Avaluació de la qualitat d’àcid nucleic.
  • Quantificació d’àcids nucleics (Bioanalyzer, Nanodrop).

Equipament

  • Affymetrix array platform (upgrade 7G).
  • Real time quantitative PCR ABI 7900HT (384-well plates and TLDA).

Subvencions

  • IRHSCSP. “Affymetrix Microarrays System”. Cofinançament: FEDER.
  • IRHSCSP. “Real time quantitative PCR ABI Prism 7000”. IF02/3693. Cofinançament: FEDER.
  • IRHSCSP. “DNA genetic analyzer and protein arrays platform for the Genomics and Proteomics area of the Technical Laboratory for scientific and technical support”. IF07/3675-1. Cofinançament: FEDER.

Formularis

Formulari Servei Genòmica

Formulari Servei Transcriptòmica

Darrera actualització: 23 de maig de 2017

Aquest lloc web utilitza cookies per millorar l'experiència de navegació i realitzar tasques analítiques. Si continues navegant, considerem que n’acceptes l’ús. Més informació

Estic d'acord